探测灵敏度是指生物芯片检测仪器能够将芯片斑点从背景区分开，并且GRM21BR71H104KA01L探测到的斑点荧光的最小浓度值，单位一般用荧光分子数／每平方微米表示。目前国外最好的检测仪能够达到O.l个荧光分子／m2。

   激光共聚焦扫描仪的探测器采用的是光电倍增管，其在可见光范围内是灵敏度最高的探测器，可探测到一个光子的存在，光电倍增管内的功率放大器可将光信号转化为电信号并放大100万倍，通过改变光电倍增管的电压可以很方便地改变光电倍增管的增益即灵敏度，目前国外最好的共聚焦扫描仪能够达到0.1荧光分子／m2。CCD对微弱信号的放大功能不及PMT，在低亮度背景下，限制了微弱信号的检测，CCD检测仪的灵敏度能够达到0.5荧光分子／岬12。

   分辨率

   生物芯片检测仪的分辨率表示的是能够分辨生物芯片斑点的最小细节的能力。生物芯片的微阵列点的直径范围通常在150～500 ym，对点进行精确的分析就要求检测仪能够将每个阵列点分割成尽可能多的像素。有意义的像素越多，在进行荧光信号的定量分析时每个点的边缘就可以分析的越准确，就越易与其他非特异的信号区分开。一般来说，微阵列的像素大小（或者说空间分辨率）不应大于最小徼阵列点直径的1/8～1110，例如，20 ym…的分辨率可以检测160 lim的点。

   激光共聚焦扫描仪的分辨率是由针孔的大小和其扫描步距决定的，激光经聚焦后产生极小的光斑，在光电倍增管前运用了探测针孔，因而具有较高的分辨率，可达几微米。CCD检测仪的分辨率由其CCD相机的像元尺寸和像素、成像视场、成像物镜的缩小倍率等决定，目前性能最优的CCD的靶面尺寸也只有16 mmx12 mm(像元尺寸10 Um)，因此要达到整个芯片面积20 mm×50 mm，必须缩小成像才能完成，检测仪的空间分辨率就只能达到30 ym左右，如果要提高分辨率，则只有采取图像缝合技术，增加二维机械扫描台，增加系统的复杂程度和成本。