如图12.24所示，由激光器发射出来的激光由透镜A先扩展成直径较粗的光柱，经激GL830-128发窄带干涉滤光片B，过滤除去其他波长的光，这样可大大降低检测的背景，再由透镜C重新聚焦后，由二色分光镜D反射至物镜组E，物镜组E将激光聚焦生物芯片上(光斑直径小于5 ym);标记有荧光染料的靶分子在激光激发下产生的荧光由物镜E捕获后变成平行光，再通过二色分光镜D、反射镜F使发射的荧光进入到干涉滤光片组G，以滤除发射荧光以外的光，再由透镜H聚焦在共聚蕉光阑I上，通过光阑的光最后由光电倍增管接收变成电信号，经放大、滤波、A/D转换等处理后送入计算机，即完成了对一点的测量，再由计算机控制二维扫描工件台，就可实现对整个芯片的扫读。由于采用了共聚焦光路，且光阑孔的孔径设计得较小，使正确聚焦在生物芯片表面所产生的荧光能由第二个透镜组聚焦通过光阑小孔，相反，芯片下表面或芯片上表面灰尘粒以及杂散光不能聚焦到光阑小孔而被挡住，这样可大大减少由于片基和灰尘产生的背景荧光。

   图12.24激光共聚焦测量光路原理图