在手动设置时需注意参考电源(vref)引脚的设置规则，这一步在自动设置中是由设计工具完成的。在了解了设置规则后，设计流程与自动设置基本相同。
　　设置规则如下。
　　
　　(1)只有在xc2cl28以上的器件中才提供sstl2-1、sstl3-1和hstl-1接口标准，这些标准需要提供参考电源。而且在这些器件中将所有的输入/输出引脚按块(bank)来划分，每一个块中不允许多个标准共存。
　　
　　(2)在布局rref时，每个vref仅能支持6个焊盘(pad)的距离长度。焊盘与引脚(pin)是有区别的，焊盘是指器件内部管芯的焊盘，无法看到；而引脚是能够观察到的物理引脚。相同规模器件的管芯是一样的，但封装引脚可以不同。因此在进行free的布局规划时，需要通过器件手册来设置。
　　
　　例如，为xc2c128的tq144封装器件分配pin12和pinl7引脚作为vref输入，经过查证，pin12对应的pad为121，而pin17对应的pad为126。由于没有超过最大的限制，所以符合规则要求。

　　（3）vref输入/输出限制：由于设计工具的原因，每个vref引脚可以支持6个单端的输入/输出引脚。因此如果设计中需要8个sstl2-l、sstl3-1和hstl-1接口标准信号，需要设置两个vref引脚。手动设计流程与自动设置方式相同，只是需在ucf文件中添加如下约束命令：

　　config vref = pxx;

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